I 1883 fik Søofficers-Foreningen i forbindelse med de nye love sit eget logo, idet man fik Marineministeriets tilladelse til at måtte benytte en krone over bogstaverne S, O og F, i hvilke der i bogstavet O er anbragt et anker. Dette har siden været foreningens mærke og signet. Flere forsøg gennem årene på at ændre dette mærke er blevet afvist.

Senest ved generalforsamlingen den 28. november 1950 blev det overvejet, om foreningen skulle ændre sit logo, der havde været i brug siden 1883. Der var ved generalforsamlingen fremsat forslag om det logo, som Det Søe-Militaire Kaart-, Archiv- og Bibliotheks-Selskab havde haft, og som foreningen nu rådede over. Den omkransende tekst skulle så ændres til Søofficers-Foreningen. Ændringen blev dog ikke gennemført, og man bibeholdt de sammenslyngede bogstaver SOF.